CHARMM

CHARMM
Desenvolvedor	Martin Karplus, Accelrys
Lançamento	1983
Versão estável	c39b1 (15 agosto 2014; 3562 dias)
Escrito em	FORTRAN 77/95
Sistema operacional	Unix-like
Gênero(s)	Dinâmica molecular
Licença	Proprietário
Página oficial	www.charmm.org

CHARMM (Chemistry at Harvard Macromolecular Mechanics) é um amplamente utilizado conjunto de campos de força para dinâmica molecular bem como o nome para o pacote de simulação dinâmica molecular e análise associado com eles.^[2]^[3] O Projeto de Desenvolvimento CHARMM envolve uma rede de desenvolvedores em todo o mundo a trabalhar com Martin Karplus e seu grupo em Harvard para desenvolver e manter o programa CHARMM. Licenças para este software estão disponíveis, mediante uma taxa, para as pessoas e grupos que trabalham na academia.

Ver também[editar | editar código-fonte]

Referências

↑ «Gromacs Downloads». gromacs.org. Consultado em 10 de março de 2016
↑ Brooks BR, Bruccoleri RE, Olafson BD, States DJ, Swaminathan S, Karplus M (1983). «CHARMM: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations». J Comp Chem. 4 (2): 187–217. doi:10.1002/jcc.540040211
↑ Brooks BR, Brooks CL 3rd, Mackerell AD Jr, Nilsson L, Petrella RJ, Roux B, Won Y, Archontis G, Bartels C, Boresch S, Caflisch A, Caves L, Cui Q, Dinner AR, Feig M, Fischer S, Gao J, Hodoscek M, Im W, Kuczera K, Lazaridis T, Ma J, Ovchinnikov V, Paci E, Pastor RW, Post CB, Pu JZ, Schaefer M, Tidor B, Venable RM, Woodcock HL, Wu X, Yang W, York DM, Karplus M (29 de julho de 2009). «CHARMM: The biomolecular simulation program». Journal of Computational Chemistry. 30 (10): 1545–1614. PMC 2810661. PMID 19444816. doi:10.1002/jcc.21287

Ligações externas[editar | editar código-fonte]

Accelrys website
CHARMM website com documentação e úteis fóruns de discussão
CHARMM tutorial
MacKerell website, incluindo um pacote de parâmetros de campo de força para o CHARMM
website de C.Brooks
Página do CHARMM em Harvard
Roux website
Website do grupo de Bernard R. Brooks
Docking@Home
CHARMM-GUI project
CHARMMing (CHARMM Interface and Graphics)
Tutorial CHARMM

[1] «Gromacs Downloads». gromacs.org. Consultado em 10 de março de 2016

[Brooks1983-2] Brooks BR, Bruccoleri RE, Olafson BD, States DJ, Swaminathan S, Karplus M (1983). «CHARMM: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations». J Comp Chem. 4 (2): 187–217. doi:10.1002/jcc.540040211

[3] Brooks BR, Brooks CL 3rd, Mackerell AD Jr, Nilsson L, Petrella RJ, Roux B, Won Y, Archontis G, Bartels C, Boresch S, Caflisch A, Caves L, Cui Q, Dinner AR, Feig M, Fischer S, Gao J, Hodoscek M, Im W, Kuczera K, Lazaridis T, Ma J, Ovchinnikov V, Paci E, Pastor RW, Post CB, Pu JZ, Schaefer M, Tidor B, Venable RM, Woodcock HL, Wu X, Yang W, York DM, Karplus M (29 de julho de 2009). «CHARMM: The biomolecular simulation program». Journal of Computational Chemistry. 30 (10): 1545–1614. PMC 2810661. PMID 19444816. doi:10.1002/jcc.21287

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