MAFFT
| MAFFT | |
|---|---|
| Desenvolvedor | Kazutaka Katoh |
| Versão estável | 6.850 (6 de março de 2011) |
| Escrito em | C |
| Sistema operacional | UNIX, Linux, Mac, MS-Windows |
| Gênero(s) | Bioinformática |
| Licença | Livre para usuários acadêmicos |
| Página oficial | website |
MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos.[1][2] MAFFT foi desenvolvida com maior velocidade para obter alinhamento múltiplo de sequências e, para tal, transformadas rápidas de Fourier foram usadas no procedimento.[3] MAFFT está disponível gratuitamente para uso acadêmico, sem qualquer garantia.[4]
Ver também[editar | editar código-fonte]
- Clustal
- PHYLIP
- MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis
- PAUP
- T-Coffee
- MUSCLE
- Bioinformática
- Filogenética computacional
- Alinhamento múltiplo de sequências
Ligações externas[editar | editar código-fonte]
- Sítio oficial
- Servidos online MAFFT
- Servidor MAFFT na EBI
- ClustalW / MAFFT / PRRN na GenomeNet
- ClustalW / TCoffee / MAFFT no MyHits, SIB
Referências
- ↑ Katoh, Kazutaka; Misawa, Kazuharu; Kuma, Kei-ichi; Miyata, Takashi (2002). «MAFFT: a novel method for rapid multiple sequence alignment based on fast Fourier transform». Nucleic Acids Research. 30 (14). p. 3059–66. PMC 135756
. PMID 12136088. doi:10.1093/nar/gkf436
- ↑ Katoh, Kazutaka; Kuma, Kei-ichi; Toh, Hiroyuki; Miyata, Takashi (2005). «MAFFT version 5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment». Nucleic Acids Research. 33 (2). p. 511–8. PMC 548345. PMID 15661851. doi:10.1093/nar/gki198
- ↑ Sharma, Kal Rengannathan (2009). Bioinformatics. Sequence Alignment and Markov Models (em inglês). New York: McGraw Hill. p. 122. ISBN 978-0-07-159306-9
- ↑ licença MAFFT
