PABPC1

PABPC1
Estruturas disponíveis PDB Pesquisa Human UniProt: PDBe RCSB Lista de códigos id do PDB 1CVJ, 1G9L, 1JGN, 1JH4, 2K8G, 2RQG, 2RQH, 2X04, 3KTP, 3KTR, 3KUI, 3KUJ, 3KUR, 3KUS, 3KUT, 3PKN, 3PTH, 4F02, 4F25, 4F26, 5DX1, 5DXA, 5DX8, 2D9P
Identificadores
Nomes alternativos	PABPC1
IDs externos	OMIM: 604679 HomoloGene: 37638 GeneCards: PABPC1
Targeted by Drug
Viroporin 3a
Ontologia genética Função molecular • GO:0001948, GO:0016582 ligação a proteínas plasmáticas • nucleic acid binding • protein C-terminus binding • translation activator activity • poly(U) RNA binding • poly(A) binding • mRNA 3'-UTR binding • RNA binding • mRNA binding Componente celular • focal adhesion • catalytic step 2 spliceosome • cytoplasmic stress granule • citoplasma • cytoplasmic ribonucleoprotein granule • spliceosomal complex • membrane • Exossoma • núcleo celular • citosol • dendrito • ribonucleoprotein granule • sinapse • messenger ribonucleoprotein complex • Partículas de ribonucleoproteínas heterogéneas Processo biológico • degradação mediada por mutação sem sentido • mRNA stabilization • mRNA splicing, via spliceosome • regulation of mRNA stability • Splicing • mRNA polyadenylation • mRNA processing • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • positive regulation of viral genome replication • translational initiation • negative regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • positive regulation of translation • silenciamento genético • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay Sources:Amigo / QuickGO
Ortólogos Espécie Humano Rato Entrez 26986 n/a Ensembl ENSG00000070756 n/a UniProt P11940 n/a RefSeq (mRNA) NM_002568 n/a RefSeq (proteína) NP_002559 n/a Localização (UCSC) n/a n/a Pesquisa PubMed n/a
Wikidata
Ver/Editar Humano

PABPC1 (proteína de ligação a poliadenilato 1, do inglês, polyadenylate-binding protein 1) uma proteína que, em humanos, é codificado pelo gene  PABPC1. A proteína PABP1 se liga ao RNA mensageiro (mRNA)e participa de diversas atividades, como exportação do RNA núcleo para o citoplasma, degradação, tradução e estabilidade. Há duas proteínas PABP1, localizadas no núcleo (PABPN1) e citoplasma (PABPC1).  A localização de PABP1 afeta a função dessa proteína e a sua interação com RNA.

Função

A proteína de ligação a poli(A) (PAB ou PABP), em complexo com a cauda 3'-poli(A) de mRNAs eucarióticosm, é necessário para a redução do tamanho da cauda poli(A) e o início da tradução. Em humanos, as PAPBS possuem uma isoforma nuclear e uma família de genes conservados com, ao menos, 3 membros funcionaisː  PABP1 (PABPC1), PABP indutível (iPABP, ou PABPC4; MIM 603407), e PABP3 (PABPC3; MIM 604680). Além disso, há pelo menos 4 pseudogenes, PABPCP1 para PABPCP4.[fornecidos pelo OMIM]

A proteína PABPC1 encontra-se no citoplasma e enriquecida  em locais de alta concentração de mRNA, como granulos de estress, corpúsculos de processamento e regiões de alta atividade translacional. PABPC1 também associa-se com o decaimento do mRNA mediado por mutações "non-sense" (NMD, nonsens mediated decay). PABPC1 liga-se à cauda poli (A) e interage com eIF4G, estabilizando a circularização de mRNAs. Esta estrutura é necessária para a prevenção da degradação do mRNA através de NMD.

No núcleo, PABP1 liga-se para a caudas poli(A) da pré-mRNAs. PABPC1 contém quatro RNA-reconhecimento de motivos (RRMs). Os dois primeiros, RRM1 e RRM2, ligam se à α-importina e a cauda poli(A) e mRNA processado. Esse recurso impede o retorno de mRNA processao de volta ao núcleo.

Interações

PABPC1 interage com:

• ANAPC5,
• CNOT7,
• EIF4G3,
• EIF4G1,
• GSPT2,
• PAIP1, e
• PAIP2.