O Campeonato Paulista de Futebol de 2006 - Série A2 foi a 60.ª edição do campeonato equivalente ao segundo nível do futebol paulista. O Barueri conquistou o título da edição após vencer a decisão contra o Sertãozinho.[1]
Primeira fase: Os 20 participantes são divididos em 2 grupos. Os integrantes de cada grupo jogam entre si, em turno e returno. Em cada grupo, As 4 equipes que mais somarem pontos nessa etapa classificam-se para a segunda fase, e os dois últimos colocados são rebaixados para a Série A3 de 2007.
Segunda fase: Os 8 classificados são divididos em 2 grupos de 4 equipes. Todos se enfrentam em turno e returno. Os dois primeiros colocados de cada grupo, estarão promovidas à Série A1 de 2007, sendo que os primeiros colocados de cada grupo passam para a fase final.
Final: Os 2 finalistas disputam entre si um jogo, que estabelece o campeão da Série A2.