DHX16

DHX16
Identificadores
Nomes alternativos	DHX16
IDs externos	OMIM: 603405 HomoloGene: 2658 GeneCards: DHX16
Ontologia genética
Função molecular	• RNA helicase activity; • nucleotide binding; • GO:0001948, GO:0016582 ligação a proteínas plasmáticas; • ATP binding; • GO:0008026 helicase activity; • hydrolase activity; • nucleic acid binding; • ATPase activity; • RNA binding; • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity;
Componente celular	• spliceosomal complex; • núcleo celular; • citoplasma; • cariolinfa; • U2-type precatalytic spliceosome;
Processo biológico	• mRNA processing; • Splicing; • mRNA splicing, via spliceosome; • metabolismo;
	Sources:Amigo / QuickGO
Padrão de expressão RNA
	Mais dados de referência de expressão
Ortólogos
	8449
	n/a
ENSG00000233561; ENSG00000206486; ENSG00000233418; ENSG00000231377; ENSG00000227222;
	ENSG00000204560; ENSG00000233049; ENSG00000226171
	n/a
	O60231; Q5SQH5
	n/a
	NM_001164239; NM_003587; NM_001363515
	n/a
	NP_001157711; NP_003578; NP_001350444
	n/a
	Wikidata
Ver/Editar Humano

Fator putativo de pré-RNAm helicase de RNA dependente de ATP DHX16 é uma enzima que em humanos é codificada pelo gene DHX16.^[2]^[3] Este gene codifica uma proteína caixa DEAD,^[4]^[5] que é um homólogo funcional da proteína Prp8 de levedura de fissão envolvida na progressão do ciclo celular. Este gene é mapeado para a região do MHC no cromossomo 6p21.3, uma região onde muitos genes de doenças malignas, genéticas e auto-imunes estão ligados.^[3]

Referências

↑ «Human PubMed Reference:»
↑ Imamura O, Saiki K, Tani T, Ohshima Y, Sugawara M, Furuichi Y (junho de 1998). «Cloning and characterization of a human DEAH-box RNA helicase, a functional homolog of fission yeast Cdc28/Prp8». Nucleic Acids Res. 26 (9): 2063–8. PMC 147520. PMID 9547260. doi:10.1093/nar/26.9.2063
↑ ^a ^b «Entrez Gene: DHX16 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16»
↑ Johnson, E. R.; McKay, D. B. (1999). «Crystallographic structure of the amino terminal domain of yeast initiation factor 4A, a representative DEAD-box RNA helicase». RNA. 5 (12): 1526–1534. PMC 1369875. PMID 10606264. doi:10.1017/S1355838299991410
↑ Takashi Kikuma; Masaya Ohtsu; Takahiko Utsugi; Shoko Koga; Kohji Okuhara; Toshihiko Eki; Fumihiro Fujimori; Yasufumi Murakami (março de 2004). «Dbp9p, a Member of the DEAD Box Protein Family, Exhibits DNA Helicase Activity». J. Biol. Chem. 279 (20): 20692–20698. PMID 15028736. doi:10.1074/jbc.M400231200

Leitura adicional

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). «Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks.». Cell. 127 (3): 635–48. PMID 17081983. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026
Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). «A protein-protein interaction network for human inherited ataxias and disorders of Purkinje cell degeneration.». Cell. 125 (4): 801–14. PMID 16713569. doi:10.1016/j.cell.2006.03.032
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. PMC 528928. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). «Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (33): 12130–5. PMC 514446. PMID 15302935. doi:10.1073/pnas.0404720101
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences.». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. PMC 139241. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). «Protein-protein interactions between large proteins: two-hybrid screening using a functionally classified library composed of long cDNAs.». Genome Res. 12 (11): 1773–84. PMC 187542. PMID 12421765. doi:10.1101/gr.406902
Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, et al. (1998). «Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro.». DNA Res. 5 (1): 31–9. PMID 9628581. doi:10.1093/dnares/5.1.31

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[1] «Human PubMed Reference:»

[pmid9547260-2] Imamura O, Saiki K, Tani T, Ohshima Y, Sugawara M, Furuichi Y (junho de 1998). «Cloning and characterization of a human DEAH-box RNA helicase, a functional homolog of fission yeast Cdc28/Prp8». Nucleic Acids Res. 26 (9): 2063–8. PMC 147520. PMID 9547260. doi:10.1093/nar/26.9.2063

[entrez-3] «Entrez Gene: DHX16 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16»

[4] Johnson, E. R.; McKay, D. B. (1999). «Crystallographic structure of the amino terminal domain of yeast initiation factor 4A, a representative DEAD-box RNA helicase». RNA. 5 (12): 1526–1534. PMC 1369875. PMID 10606264. doi:10.1017/S1355838299991410

[pmid15028736-5] Takashi Kikuma; Masaya Ohtsu; Takahiko Utsugi; Shoko Koga; Kohji Okuhara; Toshihiko Eki; Fumihiro Fujimori; Yasufumi Murakami (março de 2004). «Dbp9p, a Member of the DEAD Box Protein Family, Exhibits DNA Helicase Activity». J. Biol. Chem. 279 (20): 20692–20698. PMID 15028736. doi:10.1074/jbc.M400231200

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