A Final do Campeonato Catarinense de Futebol de 2016 - Série C será a decisão da décima terceira edição desta competição. Será realizada em duas partidas, com mando de campo alternado entre as duas equipes participantes.
Nesta final os dois clubes jogam em partidas de ida e volta e aquele que apresentar mais pontos, levando-se em consideração o saldo de gols, será declarado Campeão Catarinense da Série C de 2016, se houver empate de pontos e gols, o mandante do segundo jogo (aquele que apresentou maior pontuação nas 3 fases anteriores) será considerado vencedor.
No regulamento da terceira divisão do certame catarinense, está previsto que as duas equipes se enfrentam em dois jogos, tendo o mando de campo do segundo jogo, a primeira colocada na classificação geral.
O clube que somar mais pontos na final, estabelecendo-se como critérios de desempate saldo de gols, gols fora de casa e por último desempenho na primeira fase, será campeão da Série C de 2016.