Xist
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nomes alternativos | XIST | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IDs externos | OMIM: 314670 GeneCards: XIST | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Xist (transcrição específica inativa X) é um RNA não codificante no cromossomo X dos mamíferos placentários que atua como o principal efetor do processo de inativação X.[2] É um componente do centro de inativação do Xic - cromossomo X[3] - junto com dois outros genes de RNA (Jpx e Ftx) e dois genes de proteínas (Tsx e Cnbp2).[4]
O gene XIST humano foi descoberto por Carolyn J. Brown.
Função
[editar | editar código-fonte]A inativação de X é um processo inicial de desenvolvimento em fêmeas de mamíferos que silencia transcricionalmente um dos pares de cromossomos X, fornecendo assim equivalência de dosagem entre machos e fêmeas. O processo é regulado por vários fatores, incluindo uma região do cromossomo X chamada centro de inativação X (XIC).[5]
Mecanismos moleculares de inativação do cromossomo X
[editar | editar código-fonte]Nos mamíferos, machos e fêmeas variam geneticamente em seus cromossomos sexuais - XX nas fêmeas e XY nos machos. Isso leva a um desequilíbrio potencial, pois mais de mil genes no cromossomo X seriam expressos em dose dupla nas mulheres em comparação aos homens. Para manter esse desequilíbrio os embriões femininos interromperam a expressão dos genes em um de seus dois cromossomos X.
Sabe-se que uma molécula chamada Xist (transcrição específica X-inativa) inicia o processo. Xist é um RNA longo não codificante - um tipo de molécula criada usando o DNA da célula como modelo, mas que não contém instruções para produzir uma proteína. Xist reveste o cromossomo a partir do qual é expresso e induz o silenciamento.[6]
A proteína SPEN (proteína que interage com Msx2) desempenha um papel crucial no processo de inativação do cromossomo X, onde embriões de mamíferos fêmeas silenciam a expressão gênica em um de seus dois cromossomos X. Xist mobiliza e liga SPEN, que se acumula ao longo do cromossomo X. O SPEN interage com as regiões reguladoras dos genes ativos. Assim que ocorre o silenciamento genético, o SPEN é desativado. Os genes permanecem inativos pelo resto da vida útil da célula. Um domínio específico do SPEN chamado SPOC desempenha o papel principal no silenciamento de genes. Ele reprime a transcrição do DNA para o RNA e interage com várias proteínas envolvidas na síntese do RNA, bem como na remodelação e modificação da cromatina.[7]
Referências
- ↑ «Human PubMed Reference:»
- ↑ «Entrez Gene: XIST X (inactive)-specific transcript»
- ↑ Chow JC, Yen Z, Ziesche SM, Brown CJ (2005). «Silencing of the mammalian X chromosome». Annual Review of Genomics and Human Genetics. 6: 69–92. PMID 16124854. doi:10.1146/annurev.genom.6.080604.162350
- ↑ Chureau C, Prissette M, Bourdet A, Barbe V, Cattolico L, Jones L, Eggen A, Avner P, Duret L (junho de 2002). «Comparative sequence analysis of the X-inactivation center region in mouse, human, and bovine». Genome Research. 12 (6): 894–908. PMC 1383731
. PMID 12045143. doi:10.1101/gr.152902 (inativo 22 de janeiro de 2020)
- ↑ Beletskii A, Hong YK, Pehrson J, Egholm M, Strauss WM (julho de 2001). «PNA interference mapping demonstrates functional domains in the noncoding RNA Xist». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (16): 9215–20. PMC 55400
. PMID 11481485. doi:10.1073/pnas.161173098
- ↑ «How females shut off their second X chromosome?». Tech Explorist (em inglês). 7 de fevereiro de 2020. Consultado em 10 de fevereiro de 2020
- ↑ Dossin, Jan J.; Pinheiro, Inês; Żylicz; Roensch, Julia; Collombet, Samuel; Le Saux, Agnès; Chelmicki, Tomasz; Attia, Mikaël; Kapoor, Varun (5 de fevereiro de 2020). «SPEN integrates transcriptional and epigenetic control of X-inactivation». Nature (em inglês): 1–6. ISSN 1476-4687. doi:10.1038/s41586-020-1974-9
Leitura adicional
[editar | editar código-fonte]- Brown CJ, Ballabio A, Rupert JL, Lafreniere RG, Grompe M, Tonlorenzi R, Willard HF (janeiro de 1991). «A gene from the region of the human X inactivation centre is expressed exclusively from the inactive X chromosome». Nature. 349 (6304): 38–44. PMID 1985261. doi:10.1038/349038a0
- Brown CJ, Lafreniere RG, Powers VE, Sebastio G, Ballabio A, Pettigrew AL, Ledbetter DH, Levy E, Craig IW, Willard HF (janeiro de 1991). «Localization of the X inactivation centre on the human X chromosome in Xq13». Nature. 349 (6304): 82–4. PMID 1985270. doi:10.1038/349082a0
- Clemson CM, McNeil JA, Willard HF, Lawrence JB (fevereiro de 1996). «XIST RNA paints the inactive X chromosome at interphase: evidence for a novel RNA involved in nuclear/chromosome structure». The Journal of Cell Biology. 132 (3): 259–75. PMC 2120729
. PMID 8636206. doi:10.1083/jcb.132.3.259
- Hendrich BD, Plenge RM, Willard HF (julho de 1997). «Identification and characterization of the human XIST gene promoter: implications for models of X chromosome inactivation». Nucleic Acids Research. 25 (13): 2661–71. PMC 146792
. PMID 9185579. doi:10.1093/nar/25.13.2661
- Plenge RM, Hendrich BD, Schwartz C, Arena JF, Naumova A, Sapienza C, Winter RM, Willard HF (novembro de 1997). «A promoter mutation in the XIST gene in two unrelated families with skewed X-chromosome inactivation». Nature Genetics. 17 (3): 353–6. PMID 9354806. doi:10.1038/ng1197-353
- Hong YK, Ontiveros SD, Strauss WM (março de 2000). «A revision of the human XIST gene organization and structural comparison with mouse Xist». Mammalian Genome. 11 (3): 220–4. PMID 10723727. doi:10.1007/s003350010040
- Hall LL, Byron M, Sakai K, Carrel L, Willard HF, Lawrence JB (junho de 2002). «An ectopic human XIST gene can induce chromosome inactivation in postdifferentiation human HT-1080 cells». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 99 (13): 8677–82. PMC 124357
. PMID 12072569. doi:10.1073/pnas.132468999
- Ganesan S, Silver DP, Greenberg RA, Avni D, Drapkin R, Miron A, Mok SC, Randrianarison V, Brodie S, Salstrom J, Rasmussen TP, Klimke A, Marrese C, Marahrens Y, Deng CX, Feunteun J, Livingston DM (novembro de 2002). «BRCA1 supports XIST RNA concentration on the inactive X chromosome». Cell. 111 (3): 393–405. PMID 12419249. doi:10.1016/S0092-8674(02)01052-8
- Kawakami T, Okamoto K, Sugihara H, Hattori T, Reeve AE, Ogawa O, Okada Y (abril de 2003). «The roles of supernumerical X chromosomes and XIST expression in testicular germ cell tumors». The Journal of Urology. 169 (4): 1546–52. PMID 12629412. doi:10.1097/01.ju.0000044927.23323.5a
- Pugacheva EM, Tiwari VK, Abdullaev Z, Vostrov AA, Flanagan PT, Quitschke WW, Loukinov DI, Ohlsson R, Lobanenkov VV (abril de 2005). «Familial cases of point mutations in the XIST promoter reveal a correlation between CTCF binding and pre-emptive choices of X chromosome inactivation». Human Molecular Genetics. 14 (7): 953–65. PMID 15731119. doi:10.1093/hmg/ddi089
- Vasques LR, Stabellini R, Xue F, Tian XC, Soukoyan M, Pereira LV (2007). «XIST repression in the absence of DNMT1 and DNMT3B». DNA Research. 12 (5): 373–8. PMID 16769694. doi:10.1093/dnares/dsi013
- Cohen HR, Panning B (agosto de 2007). «XIST RNA exhibits nuclear retention and exhibits reduced association with the export factor TAP/NXF1». Chromosoma. 116 (4): 373–83. PMID 17333237. doi:10.1007/s00412-007-0100-1
- Chow JC, Hall LL, Baldry SE, Thorogood NP, Lawrence JB, Brown CJ (junho de 2007). «Inducible XIST-dependent X-chromosome inactivation in human somatic cells is reversible». Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (24): 10104–9. PMC 1891207
. PMID 17537922. doi:10.1073/pnas.0610946104
- Vincent-Salomon A, Ganem-Elbaz C, Manié E, Raynal V, Sastre-Garau X, Stoppa-Lyonnet D, Stern MH, Heard E (junho de 2007). «X inactive-specific transcript RNA coating and genetic instability of the X chromosome in BRCA1 breast tumors». Cancer Research. 67 (11): 5134–40. PMID 17545591. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-0465
- Plath K, Mlynarczyk-Evans S, Nusinow DA, Panning B (2002). «Xist RNA and the mechanism of X chromosome inactivation». Annual Review of Genetics. 36: 233–78. PMID 12429693. doi:10.1146/annurev.genet.36.042902.092433
- Brockdorff N (julho de 2002). «X-chromosome inactivation: closing in on proteins that bind Xist RNA». Trends in Genetics. 18 (7): 352–8. PMID 12127775. doi:10.1016/S0168-9525(02)02717-8
- Panning B, Dausman J, Jaenisch R (setembro de 1997). «X chromosome inactivation is mediated by Xist RNA stabilization». Cell. 90 (5): 907–16. PMID 9298902. doi:10.1016/S0092-8674(00)80355-4
- Chaumeil J, Le Baccon P, Wutz A, Heard E (agosto de 2006). «A novel role for Xist RNA in the formation of a repressive nuclear compartment into which genes are recruited when silenced». Genes & Development. 20 (16): 2223–37. PMC 1553206
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- Brockdorff N, Ashworth A, Kay GF, Cooper P, Smith S, McCabe VM, Norris DP, Penny GD, Patel D, Rastan S (maio de 1991). «Conservation of position and exclusive expression of mouse Xist from the inactive X chromosome». Nature. 351 (6324): 329–31. PMID 2034279. doi:10.1038/351329a0
- Sado T, Brockdorff N (janeiro de 2013). «Advances in understanding chromosome silencing by the long non-coding RNA Xist». Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences. 368 (1609). 20110325 páginas. PMC 3539355
. PMID 23166390. doi:10.1098/rstb.2011.0325
- Pennisi E (maio de 2013). «Long noncoding RNAs may alter chromosome's 3D structure». Science. 340 (6135). 910 páginas. PMID 23704542. doi:10.1126/science.340.6135.910-a