Tem um clima quente e temperado. Existe uma pluviosidade significativa ao longo do ano em São Francisco. Mesmo o mês mais seco ainda assim tem muita pluviosidade. De acordo com a Köppen e Geiger a classificação do clima é Cfa. A temperatura média anual em São Francisco é 20.8 °C. A média anual de pluviosidade é de 1824 mm.